Клиничното значение на AFP или алфа-фетопротеина зависи от контекста, в който се измерва. Ето някои от основните клинични значения на AFP:
1. Откриване на серумно съдържание на AFP при деца: повишено съдържание на AFP при рак на черния дроб, хепатобластом, гонаден областом, хепатит и др.
2. Откриване на серумно съдържание на AFP при възрастни: съдържанието на AFP е повишено при 60% ~ 70% пациенти с първичен рак на черния дроб, както и при пациенти с рак на тестисите, тумор на яйчниците, злокачествен тератом, рак на панкреаса, рак на стомаха, рак на червата и рак на белия дроб.
3. При пациенти с доброкачествени чернодробни заболявания като остър и хроничен хепатит и цироза, серумните нива на AFP се повишават в различна степен, но повечето от тях са по-ниски от 1000ug/L, което е свързано със степента на некроза и регенерация на чернодробните клетки.
4. Повишаването на AFP при доброкачествени чернодробни заболявания е преходно и продължава 2-3 седмици. Злокачествените тумори са постоянно повишени. Следователно, динамичното наблюдение на серумното съдържание на AFP може не само да диференцира доброкачественото чернодробно заболяване от злокачественото чернодробно заболяване, но също така да диагностицира рак на черния дроб в ранен стадий.
5. При физиологични условия алфа-фетопротеинът се секретира от новородени наивни хепатоцити, докато феталните хепатоцити не са напълно развити (диференцирани). Количеството секретиран алфа-фетопротеин е голямо, което може да навлезе в кръвта на майката чрез кръвта от пъпната връв, така че бременните жени по време на бременност ще бъдат положителни за алфа-фетопротеин.